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我国学者在新型单细胞测序方法及眼干细胞发育分化转录调控领域研究取得重要进展

广东省“珠江人才计划”本土创新科研团队项目、国家自然科学基金项目(批准号:8153002881721003)等资助下,中山大学中山眼科中心刘奕志/胡友金团队在单细胞测序和干细胞调控领域取得重要进展,研究成果以“Single-cell RNA cap and tail sequencing (scRCAT-seq) reveals subtype-specific isoforms differing in transcript demarcation”为题,于20201013日在Nature Communications (《自然-通讯》)上发表。胡友金、钟嘉纬为共同第一作者,刘奕志和胡友金为该文章的共同通讯作者。

论文连接:https://rdcu.be/b8rWZ

基因转录调控是细胞遗传信息传递和表达的关键环节,是干细胞向各种功能细胞分化的重要命运决定因素。解析干细胞分化过程中基因转录构象改变和时空表达特点,对利用干细胞进行组织器官再生的转化研究具有重要意义。

单细胞测序是目前最有希望获取细胞整体遗传信息的有力工具。该研究发明一种新型的单细胞测序技术(scRCAT-seq),通过对转录本的首尾两端进行靶向捕获,精确鉴定出调控细胞基因转录的重要位点:可变转录起始位点(TSS)和可变转录终止位点(TES)。TSSTES的差异决定不同转录本的空间异构体,继而影响基因表达的稳定性。与同类已报道技术相比,scRCAT-seq具有低成本、高效的优势,检测体量约为同类技术7倍,准确性约为同类技术4-5倍。

借助scRCAT-seq,研究者首次绘制出胚胎干细胞向眼视网膜细胞分化过程的转录异构体动态表达图谱,鉴定出关键的转录调控靶点CCND1异构体。scRCAT-seq有望应用于发现特定细胞类型中的新基因和转录异构体,助力完成“国际人类细胞图谱计划”。



研究护士的苦与乐

作者: 李游方  刘玉红


     2年半前,由于岗位调动的关系,我来到了现在的科室——临床研究中心,成为一名研究护士。新到一个岗位,心情是五味杂陈的,既有对原科室的留恋,又有对新科室新岗位的憧憬,同时,对于“研究护士”这一角色也充满了茫然。刚到临床研究中心的时候,我对于什么事临床研究一无所知,深觉自己懂得的知识太少太浅,面对要重新学习,从头开始的挑战,感到无所适从。


     研究护士是做什么的?许多小伙伴和老师都这样问我,刚开始的时候,我也说不出个理所然。但是很快,我就被派到中大肿瘤医院研究中心进修,深入地学习研究护士的工作职责和内容;同时,开始参加各种与临床研究相关的学习班、讲座和俱乐部。渐渐地,我开始了解研究护士这个岗位的职责,研究护士是在主要研究者的授权下,参与临床研究工作,工作内容包括了:研究受试者管理,研究文件管理、项目运行协调、试验样本收集处理等等。伴随着这份了解,我明白这是一份和临床护士很不一样的工作,并开始期待真正地融入到这份新的角色中去。


     我第一个接触的项目是眼底病BRVO和CRVO项目,其中的苦与乐,当真是刻骨铭心。由于缺乏实战经验,再加上眼科项目本身的一些特殊性,我对项目可能遭遇的问题没有预见性,导致了后面实施困难重重。项目启动后,为了存放项目资料,我向申办方申请了购买文件柜,但由于之前没有做好调查和沟通,买了个很大的柜子,病房根本找不到地方放;教授要求当天注药的病人要尽早送到手术室,检查室的老师说检查需要排队;教授说试验不能让病人交费,财务科又说必须病人先交费后再报销;研究医生说忙,没时间写病历,由学生代写,项目质量检查的时候质控老师说不规范……第一次面临这些问题的时候,我简直要崩溃了!开始反思自己是不是不适合这份工作?


     所幸,在研究中心领导和老师的帮助指导下,我学会了多方协调,多面工作,我一边和护长申请将文件柜暂放,一边寻思哪里还可以更妥善的保管研究资料;一边积极和教授及检查室老师提前做好沟通,一边叮嘱患者早到,提前帮他们做好各种准备;同时,将遇到的困难和研究团队、申办方等积极沟通,请各方配合协助解决……而且,在忙碌的工作中,我还不断地加强GCP的学习,更加地充实自己的专业知识。


     不经历风雨怎能见彩虹?正是通过许多挫折我学会了准备项目启动会议,如设备人员是否到位,是否符合资质;我学会了如何安排受试者随访、检查,如何在试验过程中保护受试者;认真填写病历报告表(CRF),并进行数据录入,确保其真实完整;我学会了发现不良事件,协助研究者判断不良事件的程度、因果关系;保存管理相关文书等等。也是通过不断发现问题和解决问题使我对临床试验有了一个科学概念,同时巩固了我的药物临床试验以及GCP知识,提高了沟通协调、处理问题能力及团队协作精神。


     于是我慢慢觉得虽然总是遇到很多麻烦,时常还有些小紧张,心里没底的,甚至还会遭受误会和委屈,但雨过天晴后,回过头看这些的困难挫折只是我作为研究护士成长过程中的小小插曲,成为了美好的回忆和经验知识的积累。临床护士有临床护士的优秀,研究护士的工作则充满了更多地未知和挑战,能够不断地接触到各种领域和学习到更多更新的知识。工作中需要熟练运用各种办公软件及英语,在学习这些的过程中也充实了自己提高了自身综合水平,我觉得这个过程是一种享受。


     随着当代临床试验的不断进步与发展,国际临床研究专业协会ACRP(Association of Clinical Research Professionals)作为临床研究权威组织对研究护士有着更高的要求。研究护士需具备临床试验设计和分析相关的科学概念知识、伦理知识、GCP知识等专业知识,学会药物管理、数据管理和研究地点的管理,同时具备一定的领导力、沟通能力和团队协作精神,这些要求对我来说都是奋斗的目标。


     做研究护士两年多来,经历了许多挫折和困惑,但也收获了进步和成长,在领导、老师和同事的帮助与关心中,我感恩过去,展望未来,个人的能力和素养离ACRP的要求还很远,但是我相信一张白纸,只要勤奋努力,也能写出优美的文字。相信在眼科中心这棵大树下,只要一步一脚印,我们研究护士这个护理队伍中的新芽,一定会越来越壮大和成熟!